到了乾清宫，顺治登上玉座，皇后在宫女的搀扶下，着黄色锦服，披五彩绣帔，金凤盘绕，珠翠盈头，满身珠光宝气，徐徐步行上殿。由礼部尚书捧读玉册，鸿胪寺正卿赞礼，引导皇后跪伏听命。读完玉册，鸿胪寺正卿引导皇后起身，文华殿大学士捧上皇后宝瓕，武英殿大学士捧上皇后瓕绶，由坤宁宫总监跪接，转授给宫眷佩在皇后身上。皇后再向皇帝跪伏谢恩。之后，皇帝退朝，皇后坐上龙椅，接受群臣贺拜。然后，皇后再入宫，在礼乐伴奏声中与皇帝行礼。大婚典礼至此结束。
顺治因厌恶多尔衮与太后的暧昧关系，所以也对皇后心存芥蒂，始终冷落皇后，尽管皇后聪明美丽。尤其顺治喜欢简朴，而皇后好铺张奢华，性又善妒，更不得顺治欢心。所以，仅过了两年，皇后便被降为静妃，改住别宫。这以后，前皇后的堂妹、蒙古科而沁贝勒绰尔济的女儿为继后，称孝惠皇后，即小博尔济吉特氏。但依然不为顺治所中意。
顺治宠爱董鄂妃，便又想借故废掉孝惠皇后。幸亏太后讲情，也因皇后历来温厚纯良，这才使顺治作罢。但皇后一直没有得到顺治的关爱，独居西宫，形如守寡。不久，董鄂妃染疾身亡。顺治郁郁寡欢，第二年便卧床不起，很快即随董鄂妃而去，死时才二十四岁。
大、小博尔济吉特氏便双双守寡，可怜她们从未得到丈夫的关心，更在如花年纪丧夫守寡，从此独对清灯，无限凄凉。其中孝惠皇后一直活到康熙五十六年才死，享年七十七岁。
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