遗址中有两层文化层，一为大坌坑文化；另一为黑色陶文化层，可能属於大湖文化，遗址因溪床堆积深厚，大湖文化层在地表下约1m，大坌坑文化层约在地表下6-8m。下层的大坌坑文化遗留，与台北县八里乡大坌坑遗址、高雄县林园乡凤鼻头遗址同属於大坌坑文化时期的文化遗留，此层发现有贝塚，陶器以粗绳纹陶为主，常於口缘或肩部以下通体施纹，手制、质地较松软，火候不高，器表之颜色变化大，器形有罐、碗等，纹饰及形制皆为典型大坌坑式，但较大坌坑及凤鼻头者进步，陶器的形制及纹饰显得复杂；石器方面有打制与磨制斧锄形器、磨制锛凿形器、镞形器，石器类型也较繁多；另有骨尖器，亦出现了贝塚。年代约距今6000~5000年之间。其绳纹陶文化较为进步，可能为大坌坑文化之晚期，由出土的陶石等遗留，推测当时人已知农耕，其耕作型态属於刀耕火种的游耕阶段，种植根茎类作物；而狩猎、渔捞和采集才是其主要的生业活动。而根据其他地区的大坌坑文化遗址，当时人的聚落主要分布於海边或河边阶地，属小型的定居聚落型态。
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