之後，又出现了好几次类似的情况，信众这才知道，原来这就是「清水祖师」直接示警的方式，「落鼻祖师」之名因此不胫而走。
「清水祖师」又称、「祖师公」、「清水真人」、「麻章上人」、「昭应大师」以及「三代祖师」，但一般都昵称祂为「乌面祖师公」。
「清水祖师」原名陈昭应，生於宋仁宗庆历四年（西元一四四年）的福建永春县，後移居至泉州安溪，住在清水之岩。
宋朝末年，元兵入侵中原，「清水祖师」便在大云院岀家，以僧人的身分周游闽粤一带，并劝化民众抗元。後来「清水祖师」随大静山明松禅师学禅，跟着迁往麻章一带施医济药、普救贫病的民众，被当地的民众尊称为「麻章上人」。
而传说「妈祖」曾化身为孕妇，蹲在河边洗衣服，意图点化「清水祖师」。
果真「清水祖师」见她洗得辛苦，便趋前帮忙，没想到衣服却越洗越脏，「清水祖师」心知有异，於是虚心向那孕妇请教。
「妈祖」却毫不客气地指责他，说他太脏了，不仅不能洗净衣物，不管再怎麽修行，也没有办法得道升天。「清水祖师」如遭当头棒喝，顿时开悟，当场剖开自己的肚子，取出自己的肠胃加以清洗，随即被「妈祖」引渡到西天，得道成佛。
明太祖朱元璋听闻他的事蹟，便敕封立庙来表彰祂的功绩。由於祖师生前的精舍名为「清水岩」，故被称为「清水祖师」，更被安溪一带的民众奉为守护神，并随着安溪县民移居台湾，成为泉州人最为虔信的神明。
而淡水清水岩庙中所供奉的清水祖师神像，相传是清文宗咸丰年间，由一位僧人自泉州府安溪小姑乡清水岩，奉请来台 的。而後这位僧人在台北淡水一带落脚化缘 ，後来此僧离去後，由淡水士绅翁种玉、翁瑞玉兄弟留神像奉祀，因参拜者众多，翁氏遂请祖师金身於东兴街（今淡水中正路）济生号奉祀。
据说这尊蓬莱老祖金身，是当时宋朝一位皇帝赐上等沉香宝木，分为六段雕刻而成的，至今有九百多年历史，相当的弥足珍贵。
後来在清末西元１８８４年中法战争时，相传祖师曾显灵，帮助清刘铭传击退法军，光绪皇帝因此特颁赐了三块匾额给淡水的三间庙，分别是淡水福佑宫的『翌天昭佑匾』(主祀天上圣母)，淡水龙山寺『慈航普渡匾』(主祀观音菩萨)，以及现今淡水清水岩『功资拯济匾』。
不过当时蓬莱老祖金身是奉於民宅，照礼制来说是不能接受皇帝的天恩赐匾的
，所以才赶紧设法兴建庙宇，於是就先将蓬莱老祖金身及匾额暂时寄香於艋舺清水岩，等淡水清水岩建好後，再将老祖迎回。
不过，等到昭和十三年(西元1937年)，淡水清水岩建好了，要将老祖迎回时，艋舺人却不肯将老祖金身归还淡水，说：祖师是淡水人战争时，从艋舺清水岩请去助阵的，所以应奉祀在艋舺。
之後双方打了官司，判决两地各奉祀一半，除了五六两月在淡水，七八两月在艋舺之外，其余的就是单月在艋舺，双月则在淡水。
而今清水岩乃是淡水地区的大庙，庙堂上的『蹟着小姑匾』，说明了清水祖师是源於福建安溪县小姑乡清水岩祖庙，虽然建庙不过八十余年，但是香火鼎盛，几乎家家户户都非常崇奉清水祖师。
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